1、负责监督、检查、指导关区各隶属海关和总关各业务处（室、局）贯彻执行国家和海关总署的方针政策、法律、法规及各项业务规定的情况。
2、协助关领导综合情况，研究关区海关工作的发展规划和综合性改革方案，组织推动关区政策研究和工作对策研究，提出前瞻性的建议，为关领导决策提供行政辅助；草拟总关年度工作计划、总结和综合性请示、报告、领导讲话、会议文件等重要文稿；编发《关区内通》和《关区工作研究》。
3、负责组织开展关区整体业务工作分析评估，协助关领导协调处理重大业务事项和跨部门业务事项，参与重大业务改革和建设事项的调研论证及成果转化，负责对职能管理系统、综合协调系统和网上答疑系统的日常维护及应用情况的考核评估。
4、审核以乌鲁木齐海关名义制发的各类文电。
5、组织召开关区海关综合性会议、总关关长例会、关长办公会和关务会议；督促检查会议决定事项、关领导批办事项及海关总署指示、决定的贯彻落实情况。
6、负责关区公务接待工作的管理和协调及重大活动的组织工作。
7、协助关领导安排总关机关工作、处理机关日常事务，协调处理涉及多部门的有关事项；建立关内外联系。
8、组织、指导、监督、检查关区海关信息工作，收集、整理、编发各类信息、简报等，出版《乌鲁木齐海关》报。
9、组织管理关区新闻宣传工作。
10、负责管理关区外事工作。根据总署授权，开展与有关国际组织和机构的合作交流；负责关区与周边国家海关开展边境会晤、互访及专项业务合作的组织协调；开展外事工作调研，提出可行性建议。
11、负责关区人员因公（私）出国境的审理、报批工作。
12、负责区内口岸开放、规划管理工作，办理口岸开放中涉及海关的有关事务。
13、组织推动关区海关政务信息化建设，管理总关机关政务信息化工作。
14、管理关区海关档案、保密工作。办理总关机关文电资料的收发、运转、催办