珠海出入境边防检查总站担负着为国把守国门，维护国家主权和尊严的重任，担负着珠海地区所有对外开放口岸出入境人员、车辆、船舶、飞机的边防检查、监护工作任务。下辖拱北、九洲、湾仔、横琴、高栏、万山、斗门、茂盛围等八个边检站，其中拱北边检站已成为我国陆路旅检第一大站，九洲站已成为水路旅检第二大站。2011年，总站年验放旅客超过1亿人次。
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11158国家民族事务委员会--国家民委民8709国家统计局重庆调查总队--国家统8665国家统计局重庆调查总队--国家统7465国家民族事务委员会--国家民委民6248宁波海关--隶属海关--监管（一）5162上海海关--副厅级隶属海关办公综4693上海出入境边防检查总站--上海出4594商务部--办公厅等（详见备注）--4347铁道部--政策法规司--政策研究处4346国家工商行政管理总局--商标局--